御祭神は猿田彦大神（さるたひこのおおかみ）

別宮椿岸神社は猿田彦大神の妻神天鈿女命（あめのうずめのみこと）を主神とし、鎮魂の神・夫婦円満・芸能上達・縁結びの神として古来より信仰されている。